tameshita新しいツールを実際に動かした記録

Ptree — 2種の共通祖先を1画面で出せる系統樹サイト(英語)動いた

生物の分類を界→門→綱→目と列で辿りながら、寿命・繁殖・化石の最古年代・分布といった形質を横並びで読めるブラウザ上の系統樹。2つの分類群を並べて共通祖先まで出せるので、「この生き物とこの生き物はどこで枝分かれしたのか」を1画面で確かめたい時に開く。

配布元: https://ptree.org/  / 2026-09-08 時点で確認

この日に実際に動かした結果です。内容の誤りに気づかれた場合はお問い合わせください。確認のうえ訂正します。

掲載した画面は Ptree のものです。手順の説明に必要な範囲を引用しています。

使い方

やること:2つの分類群を並べ、形質の違いと共通祖先を1画面で出す。

  1. ptree.org を開く。登録もログインも無く、開いた時点で全機能が使える。

    左下に KINGDOM の列が出て、animals / plants / Viruses などが並ぶ。

    左下に KINGDOM の列が出て、animals / plants / Viruses などが並ぶ。
  2. 右上の検索欄に学名か英名を入れ、候補から選ぶ。

    Ginkgo

    Ginkgoopsida / Ginkgo / Ginkgo biloba が候補に出る。選ぶと KINGDOM から下の列がその系統まで自動で展開する。

  3. 列の中のノードを選ぶ。上部の形質表がその分類群の値に入れ替わる。

    Nutrition が all photosynthetic、Earliest fossil が 379–382.31 Ma のように表示される。

  4. 右下の Compare タブに切り替え、木のノードを枠へドラッグする。2つ目も同じようにドラッグする。

    Drop taxa here to compare の枠に2つ並び、上に Common ancestor として vascular plants が出る。下へ送ると、形質ごとに2列で値が突き合わせられる。

    Drop taxa here to compare の枠に2つ並び、上に Common ancestor として vascular plants が出る。下へ送ると、形質ごとに2列で値が突き合わせられる。
  5. そのままURLをコピーして保存する。状態は hash に入っている。

    再読み込みしても Compare タブと2つの比較対象が復元される。

通した結果

ginkgo と conifers が2列で並び、上部に共通祖先として vascular plants が出た。行ごとに化石の最古年代・絶滅危惧の割合・落葉か常緑かを比較できる。

使ってみて良かった点

  • 登録もログインも無い。開いてすぐ全機能が使える
  • 画面の状態がURLの hash に入るので、リロードで戻り、そのまま人に渡せる
  • ヘッダーの引用符アイコンで通称と学名を切り替えられる。和名を知らなくても学名で照合できる
  • 各値に出典番号が付いていて、何件の記録に基づくかが分かる
  • 写真と分布図の出典(iNaturalist・CC-BY-NC)が画面に出ている

使ってみて不便だった点

  • 日本語は一切ない。UIもデータも英語と学名だけで、和名では検索できない
  • Wikipedia タブが木の選択と連動しない。ginkgo を選んでいるのに Lycophyte の記事が出たままだった
  • 空欄(no records)が多い。ginkgo 側は寿命も温度もpHも記録なしだった

登録まわり(実際に試した結果)

クレジットカード要らない
メールだけで開始できる
日本から使えるか使えた
日本語UIなし
確認日2026-09-08

無料で使える範囲

登録の概念そのものが無く、全機能が無料で無制限に使える。触った範囲で有料プランや回数制限の表示は出てこなかった。

実際にやってみたこと

Ginkgo を検索して系統を展開し、Compare タブで ginkgo と conifers を並べた。共通祖先が vascular plants と表示され、化石年代・絶滅危惧割合・落葉/常緑などが2列で比較できた。

詰まった点

木のノードは、選択と選択解除が同じクリックで切り替わる。1回目のクリックで選択が外れて上の表が親の値に戻ることがある

Compare へは木からのドラッグでしか入らない。検索結果から直接は入らなかった