tameshita新しいツールを実際に動かした記録

Ptreeとは?2種の共通祖先を1画面で出せる系統樹サイト(英語)動いた

生物の分類を界から目へと列で辿りながら、寿命や化石の最古年代を横並びで読める、という系統樹サイトを使ってみた。今回はイチョウと針葉樹を並べて、形質の違いと共通祖先を1画面で出すところまで試した。

配布元: https://ptree.org/  / 2026-09-08 時点で確認

この日に実際に動かした結果です。内容の誤りに気づかれた場合はお問い合わせください。確認のうえ訂正します。

掲載した画面は Ptree のものです。手順の説明に必要な範囲を引用しています。

使う前に分かること

登録不要(アカウントを作らずに使えた) 同じものの一覧
クレジットカード要求されなかった 同じものの一覧
無料で使える範囲登録の概念そのものが無く、全機能が無料で無制限に使える。 くわしく
日本から使えた
日本語UIなし(画面は英語)
確認日2026-09-08(この日に実際に動かした)

使い方

やること:2つの分類群を並べ、形質の違いと共通祖先を1画面で出す。

  1. ptree.org を開く。登録もログインも無く、開いた時点で全部使える。

    出るもの

    左下に KINGDOM の列が出て、animals / plants / Viruses などが並ぶ。

    左下に KINGDOM の列が出て、animals / plants / Viruses などが並ぶ。
  2. 右上の検索欄に Ginkgo と入れて候補から選ぶ。和名では出ないので学名か英名。

    入力するもの
    Ginkgo
    
    出るもの

    Ginkgoopsida / Ginkgo / Ginkgo biloba が候補に出る。選ぶと KINGDOM から下の列がその系統まで自動で展開する。

  3. 列の中のノードを選ぶ。選択と解除が同じクリックなので、1回目で外れて表が親の値に戻ることがあった。

    出るもの

    上の形質表がその分類群の値に入れ替わる。Nutrition が all photosynthetic、Earliest fossil が 379–382.31 Ma。寿命・温度・pH は no records。

    1つの形質は読めた。次は2つ並べる。

  4. 右下の Compare タブに切り替えて、木のノードを枠へドラッグする。検索結果からは直接入れず、木からのドラッグだけ。2つ目(conifers)も同じように。

    出るもの

    枠に2つ並び、上に Common ancestor として vascular plants が出る。下へ送ると、化石の最古年代・絶滅危惧の割合・落葉か常緑かが2列で突き合わされる。

    これで、イチョウと針葉樹の共通祖先と形質の違いが1画面に出た。ゴール。

    枠に2つ並び、上に Common ancestor として vascular plants が出る。下へ送ると、化石の最古年代・絶滅危惧の割合・落葉か常緑かが2列で突き合わされる。
  5. この画面を人に渡せるか、URL をそのままコピーして開き直してみる。

    出るもの

    再読み込みしても Compare タブと2つの比較対象が復元される。状態は URL の hash に入っている。

最後まで通した時に出たもの(実際の出力)

ginkgo と conifers が2列で並び、上部に共通祖先として vascular plants が出た。行ごとに化石の最古年代・絶滅危惧の割合・落葉か常緑かを比較できる。

良かった点

  • 登録もログインも無い。開いてすぐ全機能が使える
  • 画面の状態がURLの hash に入るので、リロードで戻り、そのまま人に渡せる
  • ヘッダーの引用符アイコンで通称と学名を切り替えられる。和名を知らなくても学名で照合できる
  • 各値に出典番号が付いていて、何件の記録に基づくかが分かる
  • 写真と分布図の出典(iNaturalist・CC-BY-NC)が画面に出ている

不便だった点

  • 日本語は一切ない。UIもデータも英語と学名だけで、和名では検索できない
  • Wikipedia タブが木の選択と連動しない。ginkgo を選んでいるのに Lycophyte の記事が出たままだった
  • 空欄(no records)が多い。ginkgo 側は寿命も温度もpHも記録なしだった

無料でどこまで使えるか

登録の概念そのものが無く、全機能が無料で無制限に使える。触った範囲で有料プランや回数制限の表示は出てこなかった。

詰まった点

木のノードは、選択と選択解除が同じクリックで切り替わる。1回目のクリックで選択が外れて上の表が親の値に戻ることがある

Compare へは木からのドラッグでしか入らない。検索結果から直接は入らなかった

まとめ

2つを並べて共通祖先を出すところまで、登録無しで届いた。画面の状態が URL に入るので、そのまま人に渡せるのは予想外に便利。引っかかったのは、和名で検索できないこと、Wikipedia タブが選択と連動しないこと、空欄(no records)が多いこと。「この生き物とこの生き物はどこで枝分かれしたか」を学名で確かめたい人向け。

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