Ptree を実際に動かしてみた動いた

生物の分類を界→門→綱→目と列で辿りながら、寿命・繁殖・化石の最古年代・分布といった形質を横並びで読めるブラウザ上の系統樹。2つの分類群を並べて共通祖先まで出せるので、「この生き物とこの生き物はどこで枝分かれしたのか」を1画面で確かめたい時に開く。

配布元: https://ptree.org/ 　／　2026-09-08 時点で確認

この日に実際に動かした結果です。内容の誤りに気づかれた場合はお問い合わせください。確認のうえ訂正します。

掲載した画面は Ptree のものです。手順の説明に必要な範囲を引用しています。

使い方

やること：2つの分類群を並べ、形質の違いと共通祖先を1画面で出す。

1. ptree.org を開く。登録もログインも無く、開いた時点で全機能が使える。

   左下に KINGDOM の列が出て、animals / plants / Viruses などが並ぶ。

   

2. 右上の検索欄に学名か英名を入れ、候補から選ぶ。

   Ginkgo

   Ginkgoopsida / Ginkgo / Ginkgo biloba が候補に出る。選ぶと KINGDOM から下の列がその系統まで自動で展開する。

3. 列の中のノードを選ぶ。上部の形質表がその分類群の値に入れ替わる。

   Nutrition が all photosynthetic、Earliest fossil が 379–382.31 Ma のように表示される。

4. 右下の Compare タブに切り替え、木のノードを枠へドラッグする。2つ目も同じようにドラッグする。

   Drop taxa here to compare の枠に2つ並び、上に Common ancestor として vascular plants が出る。下へ送ると、形質ごとに2列で値が突き合わせられる。

   

5. そのままURLをコピーして保存する。状態は hash に入っている。

   再読み込みしても Compare タブと2つの比較対象が復元される。

通した結果

ginkgo と conifers が2列で並び、上部に共通祖先として vascular plants が出た。行ごとに化石の最古年代・絶滅危惧の割合・落葉か常緑かを比較できる。

使ってみて良かった点

• 登録もログインも無い。開いてすぐ全機能が使える
• 画面の状態がURLの hash に入るので、リロードで戻り、そのまま人に渡せる
• ヘッダーの引用符アイコンで通称と学名を切り替えられる。和名を知らなくても学名で照合できる
• 各値に出典番号が付いていて、何件の記録に基づくかが分かる
• 写真と分布図の出典（iNaturalist・CC-BY-NC）が画面に出ている

使ってみて不便だった点

• 日本語は一切ない。UIもデータも英語と学名だけで、和名では検索できない
• Wikipedia タブが木の選択と連動しない。ginkgo を選んでいるのに Lycophyte の記事が出たままだった
• 空欄（no records）が多い。ginkgo 側は寿命も温度もpHも記録なしだった

登録まわり（実際に試した結果）

無料で使える範囲

登録の概念そのものが無く、全機能が無料で無制限に使える。触った範囲で有料プランや回数制限の表示は出てこなかった。

実際にやってみたこと

Ginkgo を検索して系統を展開し、Compare タブで ginkgo と conifers を並べた。共通祖先が vascular plants と表示され、化石年代・絶滅危惧割合・落葉/常緑などが2列で比較できた。

詰まった点